Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms