Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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