Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23BQ15437 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23BQ15437 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23BQ15437 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23BQ15437 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23BQ15437 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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