Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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