Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms