Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms