Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms