Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms