Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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