Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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