Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ITGB3BPQ13352 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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