Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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