Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms