Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GRIK2Q13002 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms