Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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