Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPFP49454 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPFP49454 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPFP49454 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPFP49454 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPFP49454 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPFP49454 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPFP49454 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPFP49454 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPFP49454 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPFP49454 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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CENPFP49454 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CENPFP49454 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CENPFP49454 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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