Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms