Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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