Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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