Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms