Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LIN28AQ9H9Z2 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms