Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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