Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms