Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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