Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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RPE65Q16518 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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RPE65Q16518 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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RPE65Q16518 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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