Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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