Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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E2F4Q16254 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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E2F4Q16254 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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E2F4Q16254 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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