Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CCDC6Q16204 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CCDC6Q16204 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CCDC6Q16204 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CCDC6Q16204 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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