Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USF2Q15853 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USF2Q15853 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
USF2Q15853 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USF2Q15853 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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