Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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