Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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BRD3Q15059 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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