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| BRD3 | Q15059 | PTS-202 | ENST00000524931 | 696 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008011.1-201 | ENST00000545989 | 227 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073525.1-202 | ENST00000550049 | 732 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00519-201 | ENST00000557518 | 682 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006960.3-201 | ENST00000561845 | 705 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073878.2-201 | ENST00000565449 | 385 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC067959.1-201 | ENST00000604334 | 379 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | NUTF2P8-201 | ENST00000604593 | 363 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | PCDH11X-208 | ENST00000504220 | 4017 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | MACF1-201 | ENST00000289893 | 19141 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | SYNE1-212 | ENST00000423061 | 27436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | MCF2-202 | ENST00000370573 | 2583 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAD17-206 | ENST00000358030 | 2648 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AP002963.1-201 | ENST00000530590 | 184 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP002004.1-207 | ENST00000531371 | 526 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | HOMER1-205 | ENST00000535690 | 642 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL135746.1-201 | ENST00000554205 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL391261.3-201 | ENST00000557194 | 520 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC126407.1-201 | ENST00000563044 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004147.1-201 | ENST00000580658 | 299 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC004542.2-201 | ENST00000602847 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL606490.9-201 | ENST00000603331 | 271 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008498.1-201 | ENST00000613012 | 531 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR6875-201 | ENST00000617506 | 72 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC072046.2-201 | ENST00000618366 | 268 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL731566.2-201 | ENST00000618971 | 317 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | U2SURP-214 | ENST00000493598 | 3491 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | IL33-203 | ENST00000456383 | 2501 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | TAX1BP1-213 | ENST00000543117 | 3365 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | CACNB4-222 | ENST00000636350 | 7654 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | KIAA1524-206 | ENST00000491772 | 3877 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | CAB39L-206 | ENST00000410043 | 1627 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | SYTL2-203 | ENST00000359152 | 4123 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | IQCH-201 | ENST00000335894 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RTTN-201 | ENST00000255674 | 6960 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | MDM2-207 | ENST00000360430 | 891 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP280-201 | ENST00000364196 | 304 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNA5SP479-201 | ENST00000364858 | 117 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | SPRR2D-203 | ENST00000368757 | 800 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-641P-201 | ENST00000384006 | 107 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU2-39P-201 | ENST00000410604 | 198 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AF241725.1-201 | ENST00000416182 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL358075.2-201 | ENST00000452785 | 339 nt | TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL139260.1-202 | ENST00000456813 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS27P29-201 | ENST00000463110 | 252 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | FSBP-201 | ENST00000481490 | 1158 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068587.1-201 | ENST00000483613 | 781 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC105252.1-201 | ENST00000503089 | 286 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP165-201 | ENST00000517142 | 115 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | IGHV3-76-201 | ENST00000522465 | 295 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP006245.1-201 | ENST00000522549 | 120 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | HTN3-202 | ENST00000526767 | 578 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | NCAPGP2-201 | ENST00000557911 | 754 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC084756.1-201 | ENST00000558237 | 606 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA51-201 | ENST00000606420 | 132 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC100793.4-201 | ENST00000613683 | 429 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | HTR2B-201 | ENST00000258400 | 2246 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | GTPBP8-205 | ENST00000473129 | 1518 nt | TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC110774.1-201 | ENST00000623567 | 2018 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | HNRNPC-203 | ENST00000430246 | 4501 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | ECT2-211 | ENST00000441497 | 2825 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | CEP85L-202 | ENST00000368488 | 7118 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | CDK1-202 | ENST00000373809 | 1613 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | CFHR4-204 | ENST00000608469 | 1601 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL021368.2-201 | ENST00000606125 | 5352 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC16A10-201 | ENST00000368850 | 10051 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB114-201 | ENST00000322066 | 253 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |