Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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