Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE1CQ14123 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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