Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms