Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms