Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CBFBQ13951 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms