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| NCOA4 | Q13772 | RNU6-897P-201 | ENST00000517135 | 105 nt | BASIC | 5.41 | □□□□□ -1.54 | | |
| NCOA4 | Q13772 | FAM60BP-201 | ENST00000578364 | 658 nt | BASIC | 5.41 | □□□□□ -1.54 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | CEP120-203 | ENST00000328236 | 4710 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.4 | □□□□□ -1.55 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | EIF2AK3-203 | ENST00000419748 | 4222 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.4 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | HEATR5A-203 | ENST00000543095 | 7840 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | FILIP1-202 | ENST00000370020 | 4051 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | KLHL13-203 | ENST00000371878 | 3234 nt | TSL 2 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC116096.1-201 | ENST00000566804 | 2314 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | RNU6-7-201 | ENST00000364784 | 107 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | LINC02494-201 | ENST00000509824 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC109329.1-201 | ENST00000518744 | 317 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC034114.1-201 | ENST00000520293 | 285 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | KIRREL3-AS2-201 | ENST00000532988 | 492 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC073655.2-202 | ENST00000547927 | 401 nt | TSL 3 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC044860.2-201 | ENST00000561005 | 179 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR5696-201 | ENST00000578474 | 85 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNU6-6P-201 | ENST00000606623 | 107 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR8076-201 | ENST00000611401 | 83 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AL355810.1-201 | ENST00000614629 | 552 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | LINC01232-201 | ENST00000625254 | 836 nt | TSL 5 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MYBPC1-202 | ENST00000361685 | 3871 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | PROM1-220 | ENST00000540805 | 3908 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC004160.1-212 | ENST00000421121 | 2078 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC104623.2-202 | ENST00000623477 | 4002 nt | BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MBNL1-203 | ENST00000324196 | 5225 nt | TSL 5 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CDK14-203 | ENST00000406263 | 5163 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | UGT2B7-201 | ENST00000305231 | 1887 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | ERBIN-208 | ENST00000506030 | 4386 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | DNAJC16-210 | ENST00000616884 | 5882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | STIL-204 | ENST00000396221 | 4558 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| NCOA4 | Q13772 | FOXP1-IT1-201 | ENST00000498714 | 3539 nt | TSL 2 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |