Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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