Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CUL3Q13618 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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CUL3Q13618 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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CUL3Q13618 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CUL3Q13618 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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