Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms