Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NME3Q13232 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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