Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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CNTN1Q12860 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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