Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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BPTFQ12830 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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BPTFQ12830 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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BPTFQ12830 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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BPTFQ12830 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BPTFQ12830 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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