Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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