Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms