Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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