Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDGFDQ9GZP0 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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