Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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