Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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