Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C9orf47Q6ZRZ4 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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